《分子机器》介绍了化学家如何颠覆传统制造行业“由上至下”的思路，提出了 “由下至上”的制造新方法，从分子水平构建能行使某种功能的“分子机器”。通过介绍法国化学家研制的分子轮，日本东京大学教授制造的分子剪刀和其他研究者构建的分子开关、分子马达、分子车、分子大脑等实例，向年轻学子展示未来化学制造复杂分子机器的无限可能，也提出了使这一可能成为现实所面临的挑战。